En esta diócesis, la historia comienza con las primeras charlas de Inés Ordoñez de Lanús a pedido de Monseñor Aguirre, en el año 1982. En 1987 se abre el primer grupo de oración Magnificat en la Catedral, coordinado por Roxana Maggio, seguido por otro en la parroquia Santo Domingo de Guzmán, que coordinaba Viviana Udaquiola. Así, miembros de los primeros grupos fueron “apadrinando” la creación de otros nuevos.

En 1994 es reconocida como filial por monseñor J. Casaretto. Con sede en el centro misional San Antonio de Padua, ubicado en la calle Don Bosco, en el año 2008 comienza a dictarse el Curso de Acompañamiento Espiritual (CAE) en San Isidro. De a poco, la comunidad de San Isidro, siempre muy unida a la de Buenos Aires, va consolidando su propia identidad. En 2021, asume Marieta Obligado como la primera directora de la sede, elegida por la comunidad. La sucede Consuelo Acuña, en 2025.